教堂的另外一個(gè)重點(diǎn)是彩色玻璃，在教堂內(nèi)的彩色玻璃都非常特別，用玻璃制作圖像臺(tái)凸顯出圣經(jīng)里的人物或是故事，如為基督教徒會(huì)被這里的彩色玻璃所吸引，在教堂內(nèi)部總共有56個(gè)玻璃窗，31個(gè)圓形的玫瑰圖案以及25個(gè)彩色幅彩色玻璃窗的精美圖案，但是在這56個(gè)玻璃窗只有4個(gè)是最完整無(wú)瑕的，其它的玻璃窗都是在1949-1951由當(dāng)?shù)刂鹘痰木用襁M(jìn)行一些整修，而這些彩色玻璃窗都是由法國(guó)沙特爾省的LorinFirm所制造。

古代埃及和羅馬人都擅長(zhǎng)制造小型的彩色玻璃制品。古代腓尼基在玻璃制造業(yè)中也占有重要地位，其中心產(chǎn)地是西頓和安條克等地。在公元4-5世紀(jì)的早期基督教教堂中，一些木質(zhì)窗框中鑲嵌有經(jīng)雕琢過(guò)的雪花石膏，類似玻璃般的效果。公元7世紀(jì)，英國(guó)的教堂和修道院已經(jīng)出現(xiàn)了彩繪玻璃窗。公元675年，圣本篤·波斯哥［］從法國(guó)引進(jìn)工匠，為在芒克威爾茅斯建造的圣彼得修道院窗戶進(jìn)行著色。公元8世紀(jì)以后，伊斯蘭世界的一些清真寺和公共空間也開始以彩色玻璃裝飾，基本以純粹的幾何設(shè)計(jì)為主，包含花卉和文字圖案，不表現(xiàn)人物形象和宗教偶像。
彩色玻璃，花窗玻璃為西方建筑裝飾品，常見于教堂，裝置于建筑物墻面上。在伊斯蘭教的清真寺，花窗彩色玻璃藝術(shù)也很常見。其作用原理是，當(dāng)日光照射玻璃時(shí)，可以造成燦爛奪目的效果。而在電燈時(shí)代，夜間從教會(huì)內(nèi)放射出的彩光，又是氣象萬(wàn)千。
彩繪玻璃鑲嵌畫在羅馬式時(shí)期已開始使用，但由于該建筑的窗戶面積較小，因此沒(méi)有明顯的裝飾效果；當(dāng)圣德尼教堂開始建造時(shí)，窗戶的面積大大增加，這是因?yàn)樘K熱要求教堂內(nèi)有連續(xù)的彩色光線，玻璃畫便成為哥特式藝術(shù)的組成部分